コマンドラインにて、
magick.exe mogrify -format jpg *.bmp
のようにすると、全ての bmp ファイルを jpg に一括変換します。
実際には、対象のファイルが存在するフォルダで実行するようにして、
"C:\Program Files\ImageMagick-7.1.0-Q16\magick.exe" mogrify -format jpg *.bmp
のようにmagick.exe の絶対パスを指定するのが良いと思います。
エクスプローラーで、開いているフォルダのアドレス欄に「cmd」と入力して enter を押すと、
そのフォルダにてコマンドラインが起動します。
同じように、
"C:\Program Files\ImageMagick-7.1.0-Q16\magick.exe" mogrify -format png *.jpg
のようにすると 全ての jpg ファイルを png に変換します。
imagemagick には、convert というオプションもありますが、mogrify は、その一括変換版です。
以上で説明は終了です。
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